доктор медицинских наук, профессор, Центр развития профессиональной квалификации медицинских работников (ранее Ташкентский институт усовершенствования врачей ТашИУВ)
Doctor of Medical Sciences, Professor, Center for the Development of Professional Qualifications of Medical Workers (formerly the Tashkent Institute for Advanced Medical Studies), Uzbekistan, Tashkent
докторант НУО «Казахстанско-Российский медицинский университет»
Doctoral student, Kazakh-Russian Medical University, Kazakhstan, Almaty
доктор медицинских наук, профессор, заведующий кафедрой хирургии с курсом анестезиологии и реаниматологии НУО «Казахстанско-Российский медицинский университет»
Doctor of Medical Sciences, Professor, Head of the Department of Surgery with a Course in Anesthesiology and Resuscitation, Kazakh-Russian Medical University, Kazakhstan, Almaty
Актуальность. Генетические факторы играют важную роль в формировании индивидуальной предрасположенности к заболеваниям поджелудочной железы. Варианты генов SPINK1, PRSS1 и CFTR ассоциированы с различными формами панкреатита, тогда как BRCA1 и BRCA2 имеют значение преимущественно в контексте наследственной онкологической предрасположенности. Изучение результатов молекулярно-генетического тестирования в клинической практике позволяет оценить спектр выявляемых генетических находок и определить направления дальнейших клинико-генетических исследований.
Цель исследования. Описать спектр и частоту результатов молекулярно-генетического тестирования генов SPINK1, PRSS1, CFTR, BRCA1 и BRCA2 в пилотной клинической серии пациентов с раздельным анализом на уровне уникальных пациентов и выполненных генетических исследований.
Материалы и методы. Проведено пилотное ретроспективное описательное исследование пациентов, обследованных в ТОО «Медцентр - Рахат» (г. Алматы, Республика Казахстан) в 2021-2022 гг. В анализ включены 14 уникальных пациентов и результаты 16 молекулярно-генетических исследований: SPINK1–5, PRSS1–2, CFTR – 5, BRCA1/BRCA2–4. Анализ проводили отдельно на уровне пациентов и отдельных исследований. Категориальные показатели представлены как n (%). Для долей рассчитывали точные двусторонние 95 % доверительные интервалы по методу Клоппера–Пирсона. Статистическая обработка выполнена в R 4.5.2.
Результаты. Находки, интерпретированные в исходных лабораторных заключениях как ассоциированные с повышенной восприимчивостью к панкреатиту, выявлены у 2 из 14 пациентов (14,3 %; 95 % ДИ 1,8-42,8 %). В обоих случаях зарегистрирован гетерозиготный вариант SPINK1 p.Asn34Ser (N34S). Среди пяти исследований SPINK1 данный вариант выявлен в 2 случаях (40,0 %; 95 % ДИ 5,3–85,3 %). В исследованиях PRSS1, CFTR и BRCA1/BRCA2 другие риск-ассоциированные находки согласно исходным лабораторным заключениям не зарегистрированы.
Выводы. В исследованной пилотной серии единственной риск-ассоциированной генетической находкой являлся гетерозиготный вариант SPINK1 p.Asn34Ser. Малый объём выборки и неоднородность генетического тестирования ограничивают обобщение результатов и обосновывают необходимость дальнейших исследований с большей выборкой, стандартизированным генетическим тестированием и оценкой генотип-фенотипических взаимосвязей.
Relevance. Genetic factors play an important role in determining individual susceptibility to pancreatic diseases. Variants in SPINK1, PRSS1, and CFTR are associated with different forms of pancreatitis, whereas BRCA1 and BRCA2 are primarily relevant in the context of hereditary cancer predisposition. Evaluation of molecular genetic testing results in clinical practice may help characterize the spectrum of genetic findings and inform future clinical genetic research.
Objective. To describe the spectrum and frequency of molecular genetic testing results for SPINK1, PRSS1, CFTR, BRCA1, and BRCA2 in a pilot clinical series, with separate analyses at the level of unique patients and individual genetic tests.
Materials and Methods. A pilot retrospective descriptive study was conducted among patients evaluated at Medcenter-Rakhat LLP, Almaty, Republic of Kazakhstan, in 2021-2022. The analysis included 14 unique patients and the results of 16 molecular genetic tests: SPINK1, n = 5; PRSS1, n = 2; CFTR, n = 5; and BRCA1/BRCA2, n = 4. Analyses were performed separately at the patient and individual-test levels. Categorical variables are presented as n (%). Exact two-sided 95 % confidence intervals (CIs) for proportions were calculated using the Clopper–Pearson method. Statistical analyses were performed using R version 4.5.2.
Results. Findings interpreted in the original laboratory reports as being associated with increased susceptibility to pancreatitis were identified in 2 of 14 patients (14.3 %; 95 % CI, 1.8–42.8 %). In both cases, a heterozygous SPINK1 p.Asn34Ser (N34S) variant was identified. Among the five SPINK1 tests, this variant was detected in 2 cases (40.0 %; 95 % CI, 5.3–85.3 %). No other risk-associated findings were reported for PRSS1, CFTR, or BRCA1/BRCA2 according to the original laboratory interpretations.
Conclusions. In this pilot clinical series, the heterozygous SPINK1 p.Asn34Ser variant was the only risk-associated genetic finding identified. The small sample size and heterogeneity of genetic testing limit the generalizability of the findings and support the need for larger studies using standardized genetic testing and systematic evaluation of genotype–phenotype associations.
The authors declare that there are no conflicts of interest present.