СПЕКТР РЕЗУЛЬТАТОВ ТАРГЕТНОГО МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКОГО ТЕСТИРОВАНИЯ ГЕНОВ SPINK1, PRSS1, CFTR, BRCA1 И BRCA2: ПИЛОТНОЕ ОПИСАТЕЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ

Актуальность. Генетические факторы играют важную роль в формировании индивидуальной предрасположенности к заболеваниям поджелудочной железы. Варианты генов SPINK1, PRSS1 и CFTR ассоциированы с различными формами панкреатита, тогда как BRCA1 и BRCA2 имеют значение преимущественно в контексте наследственной онкологической предрасположенности. Изучение результатов молекулярно-генетического тестирования в клинической практике позволяет оценить спектр выявляемых генетических находок и определить направления дальнейших клинико-генетических исследований.

Цель исследования. Описать спектр и частоту результатов молекулярно-генетического тестирования генов SPINK1, PRSS1, CFTR, BRCA1 и BRCA2 в пилотной клинической серии пациентов с раздельным анализом на уровне уникальных пациентов и выполненных генетических исследований.

Материалы и методы. Проведено пилотное ретроспективное описательное исследование пациентов, обследованных в ТОО «Медцентр - Рахат» (г. Алматы, Республика Казахстан) в 2021-2022 гг. В анализ включены 14 уникальных пациентов и результаты 16 молекулярно-генетических исследований: SPINK1–5, PRSS1–2, CFTR – 5, BRCA1/BRCA2–4. Анализ проводили отдельно на уровне пациентов и отдельных исследований. Категориальные показатели представлены как n (%). Для долей рассчитывали точные двусторонние 95 % доверительные интервалы по методу Клоппера–Пирсона. Статистическая обработка выполнена в R 4.5.2.

Результаты. Находки, интерпретированные в исходных лабораторных заключениях как ассоциированные с повышенной восприимчивостью к панкреатиту, выявлены у 2 из 14 пациентов (14,3 %; 95 % ДИ 1,8-42,8 %). В обоих случаях зарегистрирован гетерозиготный вариант SPINK1 p.Asn34Ser (N34S). Среди пяти исследований SPINK1 данный вариант выявлен в 2 случаях (40,0 %; 95 % ДИ 5,3–85,3 %). В исследованиях PRSS1, CFTR и BRCA1/BRCA2 другие риск-ассоциированные находки согласно исходным лабораторным заключениям не зарегистрированы.

Выводы. В исследованной пилотной серии единственной риск-ассоциированной генетической находкой являлся гетерозиготный вариант SPINK1 p.Asn34Ser. Малый объём выборки и неоднородность генетического тестирования ограничивают обобщение результатов и обосновывают необходимость дальнейших исследований с большей выборкой, стандартизированным генетическим тестированием и оценкой генотип-фенотипических взаимосвязей.

1. Kleeff, J., Whitcomb, D. C., Shimosegawa, T., et al. (2017). Chronic pancreatitis. Nature Reviews Disease Primers, 3, 17060. DOI: https://doi.org/10.1038/nrdp.2017.60

2. Mayerle, J., Sendler, M., Hegyi, E., et al. (2019). Genetics, cell biology, and pathophysiology of pancreatitis. Gastroenterology, 156(7), 1951-1968.e1. DOI: https://doi.org/10.1053/j.gastro.2018.11.081

3. Fu, Y., & Lucas, A. L. (2022). Genetic evaluation of pancreatitis. Gastrointestinal Endoscopy Clinics of North America, 32(1), 27-43. DOI: https://doi.org/10.1016/j.giec.2021.08.006

4. Suzuki, M., Minowa, K., Nakano, S., et al. (2021). Genetic abnormalities in pancreatitis: An update on diagnosis, clinical features, and treatment. Diagnostics, 11(1), 31. DOI: https://doi.org/10.3390/diagnostics11010031

5. Wang, Q. W., Zou, W. B., Masson, E., et al. (2025). Genetics and clinical implications of SPINK1 in the pancreatitis continuum and pancreatic cancer. Human Genomics, 19(1), 32. DOI: https://doi.org/10.1186/s40246-025-00740-x

6. Wang, Y. C., Masson, E., Wang, Q. W., et al. (2025). SPINK1-related chronic pancreatitis: A model that encapsulates the spectrum of variant effects, genetic complexity, and classificatory challenges. The American Journal of Human Genetics, 112(9), 2043-2066. DOI: https://doi.org/10.1016/j.ajhg.2025.07.013

7. Phadke, M. Y., & Sellers, Z. M. (2022). Current clinical opinion on CFTR dysfunction and patient risk of pancreatitis: Diagnostic and therapeutic considerations. Expert Review of Gastroenterology & Hepatology, 16(6), 499-509. DOI: https://doi.org/10.1080/17474124.2022.2084072

8. Berke, G., Gede, N., Szadai, L., et al. (2022). Bicarbonate defective CFTR variants increase risk for chronic pancreatitis: A meta-analysis. PLOS ONE, 17(10), e0276397. DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0276397

9. Paiella, S., Azzolina, D., Gregori, D., et al. (2023). A systematic review and meta-analysis of germline BRCA mutations in pancreatic cancer patients identifies global and racial disparities in access to genetic testing. ESMO Open, 8(2), 100881. DOI: https://doi.org/10.1016/j.esmoop.2023.100881

10. Bulegenova, M., Macek, M., Libik, M., et al. (2022). Mutational spectrum of the CFTR gene in the Kazakhstan population. Indian Pediatrics, 59(5), 380-383. DOI: https://doi.org/10.1007/s13312-022-2518-1

11. Richards, S., Aziz, N., Bale, S., et al. (2015). Standards and guidelines for the interpretation of sequence variants: A joint consensus recommendation of the American College of Medical Genetics and Genomics and the Association for Molecular Pathology. Genetics in Medicine, 17(5), 405-423. DOI: https://doi.org/10.1038/gim.2015.30

12. Zou, W. B., Cooper, D. N., Masson, E., et al. (2022). Trypsinogen (PRSS1 and PRSS2) gene dosage correlates with pancreatitis risk across genetic and transgenic studies: A systematic review and re-analysis. Human Genetics, 141(8), 1327-1338. DOI: https://doi.org/10.1007/s00439-022-02436-x

13. Jiang, J., Waidyaratne, G., Mussad, S., et al. (2025). Prevalence of CFTR pathogenic variants in pancreatitis: A systematic review and meta-analysis. Clinical and Translational Gastroenterology, 16(7), e00846. DOI: https://doi.org/10.14309/ctg.0000000000000846